书院，是历代州、县人为士子进修，预备科举，兴学育才之所。潮阳书院的创建，始于明朝而兴于清朝，几经兴废，按历史年代先后计，共有十三所书院分布县内各地，至清道光年间以海门莲峰书院最盛。

莲峰书院又称忠贤祠，位于潮汕名胜迹地莲花峰西北侧钟南山麓，坐北向南，座拥主峰莲花峰，背靠粤东名刹莲峰古寺，主体结构二厅二天井，纵 30.2米 、横 12.9米 ，自明代创建该址以来，闻名远近，功能合二为一，既是纪念性祠堂，又是兴学育才的书院，为清代潮阳县四大书院之一（四大书院为东山书院、莲峰书院、六都书院、贵山书院），人们出于对文天祥丞相的敬仰和怀念，四百多年来多次对其维护修缮，是一处保护完好的明清古建筑遗址。

清光绪甲申《潮阳县志》记载：“莲峰书院，在海门所城南，旧为‘忠贤祠’，道光四年海门参将何岳钟拓建，光绪四年署潮阳县令张璇，参将冯耀祖捐修，始延山长主讲官课焉（按：山长由官员聘，每年就向海门局修脯银200圆，按季缴署，其生童膏火赀计钱一百二十千，则以鸟网船秤佣金供之）”。南宋末年，元兵入侵，文天祥从江西举兵勤王，匡宋抗元。转战东南沿海，为追寻漂泊于海上“南逃”帝舟，屯兵潮阳，于公元一二七八年冬登临莲花峰眺望帝舟，为莲花峰留下了忠踪故迹；后有元朝隐士张鲁庵慕名前来，效法“首阳高风”，莲花峰因此成了后人们瞻忠仰烈的名胜迹地，成为儒道释高士隐栖“尘外”，“梅隐”之所。为纪念忠贤的爱国精神，明朝万历甲午年（1594年）由驻海门金吾将军江应龙和隐士吴从周（明朝万历礼部尚书博罗人韩日鑽为之作《 吴隐 君入祀忠贤祠》碑记，文革被毁）倡建，在莲花峰钟南山“云水结庐”处（原为元张鲁庵隐居住所及明吴从周隐居讲学之“海镜堂”）创建祠堂，因纪念文天祥及张鲁庵“一忠一贤”，故取名“忠贤祠”，之后几经修缮。随着莲花峰声誉日盛，至清道光四年（1824年）由南澳总兵蒲立勋、潮阳县令王履祥、海门营参将何岳钟拓建成“莲峰书院”，门联曰：“座拥莲峰五岭风云横笔阵，门迎练海千层波浪涌词源”。柱联：“立学因胜迹，想歌铭气壮，乃知为忠为孝即从此日焕文章。（冈州何岳钟撰并书，上联佚）”，每年逢文天祥生日（ 农历五月初二 ）及就义日（ 农历十二月初九 ），人们都举办纪念活动，隆重纪念宋文天祥丞相、 元张鲁庵 先生、明江应龙将军、 吴从周 先生及清因抗击海贼阵亡的参将陈名魁、守备李象斌六位忠臣贤士。“见贤思齐”是官府在此设立书院的根本原因，也是此处办学最大特色，为地方培育人才作出过很大贡献，“书院春雨”因此位列莲峰八景之一。至清光绪四年（1878年）由县令张璇、参将冯耀祖募资再次大修，并聘本县知名学者郑安淮主讲。莲峰有其摩崖石刻诗及《莲峰书院记》碑刻（文革被毁）；1933年由岭东佛教会根宽会长募资改建，时有清惠、潮、嘉道梁（长安人）为之作《募建忠贤祠序》碑记（文革该碑被毁），因传统木结构怕白蚁破坏，故采用钢筋水泥顶结构；1981年由政府拨款和社会各界募资再度修缮；1997年由政府拨款及莲花峰风景区管理处再度募资全面整修，修旧如旧，保持明清建筑格局，配以潮汕传统建筑装饰特色，雕梁画栋，金碧辉煌，使之面貌焕然一新。更宝贵的是书院有杨尚昆、王汉斌、廖汉生、王兆国、赛福鼎·艾则之、胡绳、赵朴初、刘海粟、陈大羽、秦咢生、阳太阳、邵华泽、郑乃珖、何克承、陈景舒、黄文宽、孙鸣邨、杨和明等党和国家领导人及书画家的丹青题辞，还镌刻着文天祥两幅墨宝真迹《木鸡集序》和《谢昌元自警座右铭》，遗容俨雅，令瞻仰者肃然起敬。

“莲花存正气，天祥树丰碑”，莲峰书院虽经历沧桑变化的洗礼，但她风采依然，如今这里成了青少年爱国主义教育基地及文物保护单位，“书院春雨”润物如初，天道好公，人心自在，她将永远伴随着那千古不息的南海涛声，背负弘扬民族正气的历史使命，启迪后人，喜迎八方宾朋！